| 自伝・戦争体験 |
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| 9-ミ | のんのんばあカッパの水(ぽっぽライブラリ. みるみる絵本) | 水木しげる著 | 文研出版 | 1975.10 |
| 150-ミ | のんのんばあとオレ(ちくま少年図書館:37. 心の相談室) | 水木しげる著 | 筑摩書房 | 1977.10 |
| 150-ミ | ほんまにオレはアホやろか(のびのび人生論:7) | 水木しげる著 | ポプラ社 | 1978.9 |
| 916-1920 | 娘に語るお父さんの戦記(河出文庫) | 水木しげる著 | 河出書房新社 | 1982.8 |
| 72-ホ-8 | 敗走記(ほるぷ平和漫画シリーズ:8) | 水木しげる作画 | ほるぷ出版 | 1983.10 |
| 72-ホ-25 | 総員玉砕せよ : 聖ジョージ岬・哀歌(ほるぷ平和漫画シリーズ:25) | 水木しげる作・画 | ほるぷ出版 | 1985.7 |
| 913.6-ミスキ | ねぼけ人生 上巻(大活字本シリーズ) | 水木しげる著 | 埼玉福祉会 | 1992.9 |
| 913.6-ミスキ | ねぼけ人生 下巻(大活字本シリーズ) | 水木しげる著 | 埼玉福祉会 | 1992.9 |
| 915.9-451 | 水木しげるのラバウル戦記 | 水木しげる著 | 筑摩書房 | 1994.7 |
| 726.101-ミスキ | 水木サンの幸福論 : 妖怪漫画家の回想 | 水木しげる著 | 日本経済新聞社 | 2004.3 |
| 916-カケハ | 昭和二十年夏、僕は兵士だった | 梯久美子著 | 角川書店 | 2009.7 |
| 妖怪画・事典 |
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| 388.1-107-1 | 水木しげるの妖怪事典 [正] | 水木しげる著 | 東京堂出版 | 1981.9 |
| 385.1-68 | 水木しげるのあの世の事典 | | 東京堂出版 | 1983.6 |
| 388.1-107-2 | 水木しげるの妖怪事典 続 | 水木しげる著 | 東京堂出版 | 1984.7 |
| 388-20 | 水木しげるの世界妖怪事典 | 水木しげる著 | 東京堂出版 | 1985.7 |
| 080-18-238 | 妖怪画談 カラー版 :[正](岩波新書:新赤版 238,288) | 水木しげる著 | 岩波書店 | 1992.7 |
| 080-18-288 | 妖怪画談 カラー版 :続(岩波新書:新赤版 238,288) | 水木しげる著 | 岩波書店 | 1993.6 |
| 080-18-342 | 幽霊画談 カラー版(岩波新書:新赤版 342) | 水木しげる著 | 岩波書店 | 1994.6 |
| 385.1-131 | 水木しげるの憑物百怪 | 水木しげる著 | 学習研究社 | 1995.11 |
| 9-ミ | 妖怪の森 : 絵巻えほん | 水木しげる著 | こぐま社 | 1995.3 |
| 9-ミ | ゲゲゲの鬼太郎妖怪島へ : 絵巻えほん | 水木しげる著 | こぐま社 | 1996.6 |
| 080-18-455 | 妖精画談 カラー版(岩波新書:新赤版 455) | 水木しげる著 | 岩波書店 | 1996.7 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 1 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 2 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 3 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 4 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 5 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 6 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 7 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 8 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 9 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 10 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 11 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388.1-ミスキ | 妖鬼化 完全版 12 | 水木しげる著 | Softgarage | 2008.1 |
| 388-Shu | 日本妖怪大全 上・妖卷(图解经典系列:68, 69) | 水木茂[著绘]/薛倩, 刘薇[译] | 陕西师范大学出版社 | 2009.1 |
| 388-Shu | 日本妖怪大全 下・怪卷(图解经典系列:68, 69) | 水木茂[著绘]/薛倩, 刘薇[译] | 陕西师范大学出版社 | 2009.1 |
| 388.1-ミスキ | 鬼太郎と行く妖怪道五十三次 | 水木しげる著 | やのまん | 2008.4 |
| 388.1-ミスキ | 妖怪「対比」図鑑 : 鬼太郎くんの仲間たち | 水木しげる監修 | やのまん | 2008.7 |
| 388.1-ミスキ | 水木しげるの妖怪地図 : 47都道府県ご当地妖怪を訪ねる(別冊太陽. 太陽の地図帖 : おとなの「旅」の道案内:008) | 水木しげる [画] | 平凡社 | 2011.7 |
| 388.1-ミスキ | 日本妖怪大全 : 妖怪・あの世・神様 決定版(講談社文庫:[み-36-15]) | 水木しげる [著] | 講談社 | 2014.2 |
| 鬼太郎シリーズ |
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| 726.1-85-1 | 墓場鬼太郎 1(貸本まんが復刻版) | 水木しげる著 | 角川書店 | 1997.7 |
| 726.1-85-2 | 墓場鬼太郎 2(貸本まんが復刻版) | 水木しげる著 | 角川書店 | 1997.7 |
| 726.1-85-3 | 墓場鬼太郎 3(貸本まんが復刻版) | 水木しげる著 | 角川書店 | 1997.7 |
| 726.1-85-4 | 墓場鬼太郎 4(貸本まんが復刻版) | 水木しげる著 | 角川書店 | 1997.7 |
| 726.1-85-5 | 墓場鬼太郎 5(貸本まんが復刻版) | 水木しげる著 | 角川書店 | 1997.7 |
| 726.1-85-6 | 墓場鬼太郎 6(貸本まんが復刻版) | 水木しげる著 | 角川書店 | 1997.7 |
| 評伝・エッセイ等 |
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| 726.1-45 | 水木しげる諷刺短篇集 | 水木しげる著 | 筑摩書房 | 1971.7 |
| 388-19 | 水木しげるの不思議旅行 | 水木しげる著 | サンケイ出版 | 1978.9 |
| 721.6-ミスキ | 猫楠 : 南方熊楠の生涯(角川文庫:10179)(角川文庫ソフィア:230) | 水木しげる | 角川書店 | 1996.10 |
| 726.101-ミスキ | 水木しげる人生をいじくり回してはいけない(人生のエッセイ) | 水木しげる著 | 日本図書センター | 2010.4 |
| 726.1-ミスキ | 神秘家列伝 其ノ3(角川ソフィア文庫: 314) | 水木しげる [著] | 角川書店 | 2005.1 |
| 543.5-ホリエ | 福島原発の闇 : 原発下請け労働者の現実 | 堀江邦夫文/水木しげる絵 | 朝日新聞出版 | 2011.8 |
